Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH1P12830 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH1P12830 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH1P12830 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH1P12830 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH1P12830 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH1P12830 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH1P12830 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH1P12830 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH1P12830 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH1P12830 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH1P12830 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH1P12830 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH1P12830 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH1P12830 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH1P12830 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH1P12830 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH1P12830 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH1P12830 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH1P12830 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms