Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LAMC1P11047 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMC1P11047 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
LAMC1P11047 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms