Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAA2P0DJI9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms