Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLBP06746 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLBP06746 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLBP06746 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLBP06746 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLBP06746 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLBP06746 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLBP06746 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLBP06746 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLBP06746 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLBP06746 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLBP06746 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLBP06746 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLBP06746 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLBP06746 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms