Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK1P06493 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK1P06493 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK1P06493 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK1P06493 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK1P06493 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK1P06493 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK1P06493 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK1P06493 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDK1P06493 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK1P06493 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms