Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VTNP04004 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTNP04004 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VTNP04004 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTNP04004 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VTNP04004 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VTNP04004 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTNP04004 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTNP04004 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTNP04004 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTNP04004 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTNP04004 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTNP04004 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTNP04004 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTNP04004 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTNP04004 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTNP04004 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTNP04004 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTNP04004 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTNP04004 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTNP04004 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms