Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND3P03897 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms