Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC2P02585 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNC2P02585 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC2P02585 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms