Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN7O95471 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN7O95471 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN7O95471 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms