Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPBO95292 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VAPBO95292 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAPBO95292 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAPBO95292 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAPBO95292 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAPBO95292 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAPBO95292 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAPBO95292 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAPBO95292 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAPBO95292 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAPBO95292 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAPBO95292 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAPBO95292 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VAPBO95292 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VAPBO95292 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VAPBO95292 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAPBO95292 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms