Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOBTB3O94955 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms