Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FLOT1O75955 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FLOT1O75955 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FLOT1O75955 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FLOT1O75955 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FLOT1O75955 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms