Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB3O75712 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB3O75712 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB3O75712 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB3O75712 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB3O75712 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB3O75712 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB3O75712 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB3O75712 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB3O75712 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB3O75712 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB3O75712 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB3O75712 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms