Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CILPO75339 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CILPO75339 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CILPO75339 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CILPO75339 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CILPO75339 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CILPO75339 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CILPO75339 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CILPO75339 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CILPO75339 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CILPO75339 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CILPO75339 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CILPO75339 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CILPO75339 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CILPO75339 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CILPO75339 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CILPO75339 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CILPO75339 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CILPO75339 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CILPO75339 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CILPO75339 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CILPO75339 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CILPO75339 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CILPO75339 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CILPO75339 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CILPO75339 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CILPO75339 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CILPO75339 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CILPO75339 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CILPO75339 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CILPO75339 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CILPO75339 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CILPO75339 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CILPO75339 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CILPO75339 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CILPO75339 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CILPO75339 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CILPO75339 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CILPO75339 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CILPO75339 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CILPO75339 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CILPO75339 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CILPO75339 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CILPO75339 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CILPO75339 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CILPO75339 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CILPO75339 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CILPO75339 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CILPO75339 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CILPO75339 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CILPO75339 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CILPO75339 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258 ms