Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT3O75175 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT3O75175 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms