Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP104O60308 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP104O60308 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP104O60308 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP104O60308 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP104O60308 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP104O60308 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP104O60308 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP104O60308 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP104O60308 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP104O60308 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP104O60308 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP104O60308 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP104O60308 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP104O60308 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP104O60308 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP104O60308 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP104O60308 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP104O60308 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEP104O60308 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP104O60308 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP104O60308 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP104O60308 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP104O60308 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP104O60308 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP104O60308 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms