Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXTL3O43909 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXTL3O43909 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL3O43909 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms