Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC25A20O43772 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A20O43772 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A20O43772 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A20O43772 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms