Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BUD23O43709 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BUD23O43709 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BUD23O43709 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BUD23O43709 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BUD23O43709 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BUD23O43709 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BUD23O43709 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BUD23O43709 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BUD23O43709 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BUD23O43709 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BUD23O43709 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BUD23O43709 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BUD23O43709 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BUD23O43709 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BUD23O43709 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BUD23O43709 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BUD23O43709 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BUD23O43709 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BUD23O43709 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BUD23O43709 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BUD23O43709 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BUD23O43709 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BUD23O43709 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms