Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B1O43520 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms