Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms