Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBTB39O15060 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBTB39O15060 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms