Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
J3QR89 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
J3QR89 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
J3QR89 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3QR89 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3QR89 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms