Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms