Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM114B3SHH9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms