Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IDSB3KWA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IDSB3KWA1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IDSB3KWA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IDSB3KWA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IDSB3KWA1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms