Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SFI1A8K8P3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFI1A8K8P3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms