Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms