Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6BA6NDN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6BA6NDN3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms