Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4D1N5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4D1N5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4D1N5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4D1N5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4D1N5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A4D1N5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms