Protein–RNA interactions for Protein: A1L188

NDUFAF8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF8A1L188 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NDUFAF8A1L188 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NDUFAF8A1L188 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms