Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEB3A0JP26 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEB3A0JP26 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms