Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQJ8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQJ8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms