Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JMD5

PRAMEF33, PRAME family member 33, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms