Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X002

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X002 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A087X002 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A087X002 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A087X002 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
A0A087X002 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
A0A087X002 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A0A087X002 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A0A087X002 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A0A087X002 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms