Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms