Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUS3Q9BZE2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms