Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms