Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms