Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYRIPQ8NFW9 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms