Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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