Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms