Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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