Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms