Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPTBN1Q01082 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms