Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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