Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SEC24A-201ENST00000322887 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SYBU-222ENST00000529175 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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