Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TPTEP56180 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms