Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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HOXD10P28358 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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HOXD10P28358 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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HOXD10P28358 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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HOXD10P28358 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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HOXD10P28358 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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