Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms